共青团皖南医学院委员会在学校党委、团省委的领导下，坚持服务党政中心工作大局与服务皖医团员青年相统一，以立德树人为主线，抓好“思想引领、素质拓展、权益服务、组织提升”四大工作，服务皖南医学院团员青年成长成才。

校团委下设办公室、组织部、宣传部和校学生会、团委新媒体中心、文化艺术教育实践中心、社团管理中心、青年志愿服务中心、大学生艺术团、大学生礼仪团、国旗护卫队8个直属团学组织。

校团委办公室

负责团委文件的整理、归档和管理。负责团委的物资的统计与管理，大学生活动中心场地及艺术服装等物品的借用管理，团委各项会议的会务安排等。

校团委组织部

负责实施校团委各全体学生骨干的日常考核与学期述职、校青马班等活动的签到考勤，统筹各学院开展智慧团建系统录入、青年大学习等工作。汇总校直属团学组织各类活动获奖情况，印发校团委的各类证书。

校团委宣传部

负责“青马工程”专题培训班学生骨干研习沙龙的登记考核，撰写团委组织的学生活动的新闻稿，绘制活动海报。

校学生会

皖南医学院学生委员会（简称“校学生会”）是在校党委领导下、校团委指导下的主要学生组织。学生会以“全心全意为同学服务”为宗旨，秉承服务广大同学、做好桥梁纽带的工作理念，在思想引领、学风建设、创新创业、权益维护、生活服务等方面开展工作。校学生会委员会、主席团由学代会选举，设有综合事务部、学术科技部、权益保障部、素质拓展部、生活服务部5个工作部门。

团委新媒体中心

皖南医学院校团委新媒体中心于2014年成立，是校团委直接指导管理的大学生新媒体工作团体。秉承“全心全意为同学服务”的宗旨，运用网络传播规律，弘扬主旋律，激发正能量，大力培育和践行社会主义核心价值观。设有文案策划部 、 新闻采编部、视觉效果部、影视技术部、数据外联部5个部门。

文化艺术教育实践中心

皖南医学院大学生文化艺术教育实践中心是校团委各大型文化艺术类活动和比赛的承办单位，负责大学生活动中心礼堂的日常管理和设备操控，为校大学生艺术展演、辩论赛、知识竞赛等校级文化艺术类活动提供场务保障和设备支持。设有文艺部、技术部2个部门。

学生社团管理中心

皖南医学院学生社团管理中心是在共青团皖南医学院委员会指导下的校级团学组织。秉持“服务社员、监察社团”的宗旨，积极引导、监督各社团创办各类丰富校园文化的活动，发挥社团育人功能。设有综合事务部、监察审计部、网络宣传部、组织管理部、第二课堂运营部五个部门。 

青年志愿者服务中心

皖南医学院青年志愿者服务中心主要负责各团学组织相关志愿服务工作的指导、管理和服务工作。长期以来坚持立足校园、奉献自己、服务社会；倡导“奉献、友爱、互助、进步”的青年志愿者精神，鼓励广大志愿者在服务他人、服务社会的同时，提高自我、锻炼自我、奋发成长成才，培养志愿者强烈的社会责任感和高尚的道德情操。设有办公室、联络部、实践部、培训部、组织部、宣传部六个部门。

大学生艺术团

皖南医学院大学生艺术团是校团委直接指导的大学生艺术团体，是我校大学生校园艺术实践活动和校园文化建设的主体之一。配备专业资深的指导老师，开展规律稳定的日常训练，提供丰富多彩的舞台机会，多次参演校内外各大型文艺展演。经过长期建设，皖南医学院大学生艺术团现设合唱队、舞蹈队、器乐队、辩论队、表演队和主持人队六支队伍。

大学生礼仪团

皖南医学院大学生礼仪团是在共青团皖南医学院委员会指导下的校级团学组织。秉持“展现大学生风采、培养礼仪文化”的宗旨，在各项大型活动中担任礼仪、礼宾等工作，展示我校大学生良好青春形象。为大型活动参演人员提供造型服务和仪态指导。如今，皖南医学院大学生礼仪团设有办公室、训练部、化妆部、组织部、宣传部、外联部6个部门。

国旗护卫队

国旗护卫队于2008年成立，是在校团委直接指导下的，以维护国旗尊严和荣誉、定期升降国旗、宣传《国旗法》、增强广大学生爱国意识为主要任务的校级学生组织。负责日常升挂国旗和重大节庆日、学校大型活动升挂国旗任务；践行爱国主义教育，宣讲国旗知识，维护国旗尊严；参与校园文化活动，担负校内大型活动的礼仪、值勤任务。设有办公室、组织部、宣传部、训练部4个部门。