共青团皖南医学院委员会在学校党委、团省委的领导下坚持服务党政中心工作大局与服务皖医团员青年相统一，以立德树人为主线，抓好“思想引领、素质拓展权益服务、组织提升”四大工作服务皖南医学院团员青年成长成才，校团委下设办公室、组织部、宣传部和校学生会、团委新媒体中心、文化艺术教育实践中心、社团管理中心、青年志愿服务中心、大学生艺术团、大学生礼仪团、国旗护卫队8个直属团学组织
校团委办公室
负责团委文件的整理、归档和管理。负责团委的物资的统计与管理，大学生活动中心场地及艺术服装等物品的借用管理，团委各项会议的会务安排等。
校团委组织部
负责实施校团委各全体学生骨干的日常考核与学期述职、校青马班等活动的签到考勤，统筹各学院开展智慧团建系统录入、青年大学习等工作。汇总校直属团学组织各类活动获奖情况，印发校团委的各类证书。
校团委宣传部
负责“青马工程”专题培训班学生骨干研习沙龙的登记考核，撰写团委组织的学生活动的新闻稿，绘制活动海报。
校学生会
皖南医学院学生委员会（简称“校学生会”）是在校党委领导下、校团委指导下的主要学生组织。学生会以“全心全意为同学服务”为宗旨，秉承服务广大同学、做好桥梁纽带的工作理念，在思想引领、学风建设、创新创业、权益维护、生活服务等方面开展工作。校学生会委员会、主席团由学代会选举，设有5个工作部门。
综合事务部
做好学生会工作运行的文档资料收集与整理，为团学组织开展各项活动提供场地和物资保障，负责管理学生活动教室的借用，以及相关活动物资的整理与借用。
学术科技部
引领学生会学风建设，举办各类知识竞赛、专题讲座，校“挑战杯”学术科技作品竞赛、大学生创业赛的赛事组织。
权益保障部
负责失物招领服务站的日常维护，建设伙食管理委员会，向学校有关部门及时反映学生意见和建议。开展法制宣传日，315主题辩论赛，光盘行动等活动。
素质拓展部
负责组织学生会部门值班、卫生检查等日常工作，为团学组织开展各项活动提供帐篷、桌椅，组织举办直属团学组织素质拓展活动、趣味运动会、体育节及各类文体活动。
生活服务部
负责校团委直属团学组织各部门的内务检查，统计各直属团学组织的物资购买需求，设计、采买、整理、分发各类活动物资和奖品。
团委新媒体中心
皖南医学院校团委新媒体中心于2014年成立，是校团委直接指导管理的大学生新媒体工作团体。秉承“全心全意为同学服务”的宗旨，运用网络传播规律，弘扬主旋律，激发正能量，大力培育和践行社会主义核心价值观。我们用相机保存大学美好回忆，运用微信公众号，QQ空间，微博，抖音搭建起学校团委和同学们的沟通桥梁，展示丰富多彩的校园生活，为校园的文化建设贡献力量。组织设有以下5个部门。
文案策划部
原创栏目策划，原创图文撰写。以丰富的视角推出各类系列文案，着眼于当代大学生喜闻乐见的文化艺术形式和时事热点。
新闻采编部
校园资讯新闻采编，公众号图文的排版和推广。负责运营皖南医学院团委官方公众号，每日推送经老师审核通过的原创图文、转载文章、校园资讯及比赛通知，做好大学生思想引领工作，切实推进校园文化建设。
视觉效果部
活动图片拍摄、艺术拍摄与后期处理。管理新媒体中心摄影及灯光设备，负责校园各重大活动的照片整理和备份。
影视技术部
视频拍摄、音频制作及抖音作品制作与运营。完善后期视频影音的剪辑及优化，努力打造有特色、有影响力的皖南医学院团委抖音平台。
数据外联部
运营团委QQ、微博，负责活动统分和联系各学院等工作。掌握趣现场、办公软件等必要技术，负责统计各大平台后台数据并做记录，为工作总结提供数据分析支持。
文化艺术教育实践中心
皖南医学院大学生文化艺术教育实践中心是校团委各大型文化艺术类活动和比赛的承办单位，负责大学生活动中心礼堂的日常管理和设备操控，为校大学生艺术展演、辩论赛、知识竞赛等校级文化艺术类活动提供场务保障和设备支持。组织下设2个部门。
文艺部
负责大学生活动中心礼堂场地的申请审批与日常管理，为在礼堂开展的各项活动提供舞台布置、场务安排和后勤保障。
技术部
负责大学生活动中心礼堂电子屏、灯光、音响等设备的运行管理和维护，为在礼堂开展的各项活动提供设备和技术保障。
学生社团管理中心
皖南医学院学生社团管理中心是在共青团皖南医学院委员会指导下的校级团学组织。秉持“服务社员、监察社团”的宗旨，积极引导、监督各社团创办各类丰富校园文化的活动，发挥社团育人功能。如今，皖南医学院学生社团管理中心设5个部门。
综合事务部
协助处理日常任务、综合后勤保障
监察审计部
监察活动、审核社团年审材料
网络宣传部
设计海报、制作媒体材料、撰写和审核新闻稿
组织管理部
组织策划活动、批发文件证书、汇编各项工作
第二课堂运营部
负责第二课堂成绩单系统运维、培训和管理
青年志愿者服务中心
皖南医学院青年志愿者服务中心是校团委直属团学组织之一，主要负责各团学组织相关志愿服务工作的指导、管理和服务工作。长期以来坚持立足校园、奉献自己、服务社会；倡导“奉献、友爱、互助、进步”的青年志愿者精神，鼓励广大志愿者在服务他人、服务社会的同时，提高自我、锻炼自我、奋发成长成才，培养志愿者强烈的社会责任感和高尚的道德情操。目前，中心设6个部门，分别为办公室、联络部、实践部、培训部、组织部、宣传部。
办公室
会务签到、财务报销、物资管理等工作
联络部
对外联系和沟通
实践部
志愿服务活动的实施、拓展与保障
培训部
志愿者技能培训
组织部
组织内部考勤评优,组织建设以及志愿中国平台管理等工作
宣传部
海报制作、活动现场的拍照和后期通讯稿的书写等宣传工作
大学生艺术团
皖南医学院大学生艺术团是校团委直接指导的大学生艺术团体，是我校大学生校园艺术实践活动和校园文化建设的主体之一。配备专业资深的指导老师，开展规律稳定的日常训练，提供丰富多彩的舞台机会，多次参演校内外各大型文艺展演。经过长期建设，皖南医学院大学生艺术团现设合唱队、舞蹈队、器乐队、辩论队、表演队和主持人队六支队伍。
大学生礼仪团
皖南医学院大学生礼仪团是在共青团皖南医学院委员会指导下的校级团学组织。秉持“展现大学生风采、培养礼仪文化”的宗旨，在各项大型活动中担任礼仪、礼宾等工作，展示我校大学生良好青春形象。为大型活动参演人员提供造型服务和仪态指导。如今，皖南医学院大学生礼仪团设6个部门。
办公室
统计数据，备份资料综合事务处理
训练部
安排训练时间和人员，参与礼仪团训练指导
化妆部
进行化妆教学，管理和采购化妆品,为校内大型晚会等活动人员化妆.
组织部
组织礼仪团整体性内部活动
宣传部
礼仪团对外宣传工作
外联部
礼仪服装的借还与其他组织交流工作以及辅助其他部门工作
国旗护卫队
国旗护卫队于2008年成立，是在校团委直接指导下的，以维护国旗尊严和荣誉、定期升降国旗、宣传《国旗法》、增强广大学生爱国意识为主要任务的校级学生组织。负责日常升挂国旗和重大节庆日、学校大型活动升挂国旗任务；践行爱国主义教育，宣讲国旗知识，维护国旗尊严；参与校园文化活动，担负校内大型活动的礼仪、值勤任务。
训练部
负责队员的体能训练及安排工作，加强队员综合素质的提高，定期开展队内考核评比，日常训练内容及时间的安排，军体拳的教学以及日常升旗和出席活动前的训练。
组织部
负责日常训练的签到签退，队内活动的组织与策划，日常升旗及一系列活动的人员安排与调动，训练请假、退队申请以及错误惩戒。
宣传部
负责国旗队对内对外的宣传工作，国旗队电子文档的收集、整理、编辑工作，国旗队相机设备的保管维护及活动、会议的拍照、摄影工作，国旗队参加节目的策划及排练，宣传内容的推送工作。
办公室
负责日常活动军装的发放与收回，制定国旗班工作进程中所需的表格、文件等，国旗队物资的上报和管理。
